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预防房颤合并症
房颤的转复带来了重要的栓塞风险，房颤持续超过48小时者需要抗凝治疗。大多数房颤相关缺血性中风，是由于血液淤滞引起左房尤其是左心耳血栓形成，继而形成体循环的栓塞。房颤患者血栓栓塞危险性分层是最佳抗栓预防的关键决定因素。 CHADS2评分系统将有中风或短暂性缺血发作病史记为2分，其他危险因素，如近期的充血性心衰、高血压、年龄>75岁、糖尿病记为1分，总分是6分，0 ～ 1 分是低危，2～3 分是中危，4～6分是高危。Brass等发现中风和房颤的老年人抗凝不充分，甚至具备理想适应症者也如此。应该记住“前三后四”，即转复前抗凝三周，转复后再用四周。心房顿抑可以出现至心脏复律后几周，此时心房腔处于血栓形成的高危险中。抗心律失常药物使用，应该在抗凝有效后再转复为NSR。房颤病人中风出现率高，推荐使用华法林长期治疗，不能耐受华法林者，阿司匹林是一个合适的选择。
房颤持续超过2天，建议行经食道超声(TEE) 检查。研究提示：TEE检查显示无心房血栓，可以进行药物或电转复，转复后口服华法林4周，无临床栓塞事件发生。TEE检查示存在心房血栓者，给予华法林治疗，推迟转复治疗。
房颤持续时间短于48小时，是否需要抗凝不太清楚，这些患者可以形成左房血栓和体循环栓塞。转复前应该用静脉肝素治疗，继而华法林抗凝3- 4周是有效的。
控制致心律失常事件
最常见的抗心律失常药物治疗引起的致心律失常事件是尖端扭转性室性心动过速（torsade de pointes），一种快速多形性室性心动过速。有些抗心律失常药物如奎尼丁，延长心室复极（如QT间期）。
Aranow 报道了一个包括59个随机试验的荟萃分析，共有受试者23,229 人，包括老年患者，研究应用奎尼丁、普鲁卡因胺、莫雷西嗪、丙吡胺、imipramine、利多卡因、室安卡因、苯妥英、美西律、安搏律定、英卡胺和氟卡胺治疗心肌梗塞后患者。结果表明，接受I 类抗心律失常药物治疗者比未接受抗心律失常药物治疗者死亡率明显增高(odds ratio = 1.14）。
非药物控制心室率方法包括心内导管消融或房室结修饰和手术造成AVB。
2000年，Pappone等研究了26名难治性房颤（阵发性或永久性）。三维电解剖左房标测证实肺静脉局灶触发病变是房颤的来源。通过环行射频消融治疗，85% 的房颤病人房颤消失。外科手术很少用于频率控制。
